西州密系列甜瓜SSR指纹图谱构建及聚类分析
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摘要
为利用SSR标记技术建立西州密系列甜瓜品种的DNA指纹图谱,实现快速准确地鉴定其品种。通过18份西州密系列甜瓜品种(系)对73对甜瓜SSR引物进行筛选,获得9对扩增稳定、呈共显性、条带清晰、多态性好的引物,其中每对引物可检测到3~6个等位变异,平均4.33个;多态性信息含量(PIC)平均值为0.45,变化范围为0.20~0.78。利用C30、MU5499、MU5554-1、SSR04219、SSR12083等5对SSR核心引物有效区分所有供试材料,并且为每份材料建立了一份独特的指纹图谱,其中'西州密25号'母本与'西州密17号'母本为同一材料。同时对18份材料进行了聚类分析,其相似系数为0.70~1.00。在相似性系数0.74处,可将供试材料分为三大类群。SSR引物适用于构建西州密系列甜瓜品种(系)的DNA指纹图谱,可为其品种鉴定提供科学依据。
关键词
厚皮甜瓜SSR指纹图谱聚类分析
