神经网络提取调控DNA组合模式的训练和可视化方法及系统

摘要

本发明公开了一种神经网络提取调控DNA组合模式的训练和可视化方法及系统,该方法包括：获取具有特定功能的DNA序列和不具有特定功能的DNA序列；对两种DNA序列进行标注,并将具有特定功能的DNA序列和不具有特定功能的DNA序列使用独热编码表示；搭建卷积神经网络,将标注后的DNA序列的独热编码作为输入,对应DNA序列标注为卷积神经网络输出的拟合值,对卷积神经网络进行训练,以使卷积神经网络识别DNA序列；使用NeuronMotif算法将训练后的卷积神经网络解耦,获得基因调控元件组合模块,并使用调控元件语法树进行表示和存储。该方法提供了一种解耦卷积神经网络的通用神经网络解释算法NeuronMotif,以发掘和可视化卷积神经网络所识别的模式。

关键词